清洗方法可分為物理清洗和化學清洗兩大類。物理清洗又能可以分為機械、水力、水汽、超聲和激光清洗等；化學清洗可以分為表面活性劑、化學溶劑、酸、堿、絡合反應和生物化學清洗等。由于石材的污染物大多寄居在石材的微孔隙內，一般物理清洗要么難以觸及，要么成本過高，因此化學清洗成為目前石材清洗的主要手段。

（1）表面活性劑是目前清洗水磨石、大理石等石質地板表面污垢的一種常用方法，表面活性劑有離子型和非離子型兩種。它們的分子含有極性與非極性兩種基因，清洗的原理是利用表面活性劑的降低界面張力、潤濕、吸附、乳化、增溶、分散等性質使污垢分子脫落、分散，從而實現清洗效果。

（2）堿清洗是利用堿性化學藥劑的皂化、乳化功能，疏松和分散污垢，常用的堿溶液為氫氧化鈉、碳酸鈉等為主要成份的水溶液，它們主要用來消除油污。油污分可皂化與非皂化兩種。可皂化油污是動植物類油污，遇堿時可形成皂類溶于水中，因而較易去除。非皂化油污系礦物油污，清洗這類油污需借助乳化劑作用，以降低油污與附著物的結合力而脫落，常見的乳化劑有磷酸三納、硅酸納等。

（3）酸清洗在石材清洗中應用較為廣泛，特別是花崗巖。無機酸中多用鹽酸、硫酸、硝酸、氫氟酸；有機酸多用檸檬酸，草酸、氨基磺酸等。如用硫酸來除銹，硫酸與氧化鐵反應后生成硫酸鐵，它能溶解于水，故鐵銹能被除掉。但是無機酸清洗的腐蝕問題值得高度重視，特別是對大理石等碳酸鹽石材，其微孔隙中殘留的酸或酸根有可能長期危害石材，即使加入緩沖劑也難以避免侵蝕問題，因此國外已傾向于應用腐蝕性較小，易凈化處理的有機酸或其他有機物清洗。

（4）絡合劑清洗是利用絡合劑對各種成垢金屬離子的絡合作用或螯合作用，使之生成可溶性的絡合物而進行清洗。常用的有機螯合劑有EDTA、DTPA和NTA等。例如，EDTA（乙二胺四乙酸）可以生成多鈉鹽，常見的是二鈉鹽或三鈉鹽，它們對各種成垢金屬離子有較強的絡合能力。近年來，美國、西歐、日本等相繼開發了一些較有效的螯合清洗法。

（5）電化學清洗是借助兩極板間的電場力（包括直流、交流和脈沖電）使污垢中的離子或極性分子按一定規律運動，或促使發生電化學反應，使污染物脫附、移動或發生化學變化而達到清洗目的。例如電流能使花崗石微孔隙中鐵離子的吸附力降低，擴散系數增大，并產生電脈。使花崗石表面和表面以下一定深度中的銹跡去除。

（6）溶劑清洗利用的是溶劑對污物的溶解能力，若已知污染物的組成，選用特定的溶劑是很有效的。例如許多有機溶劑如甲苯、二甲苯、乙酸丁脂等對油脂或油污有較強的溶解能力，用有機溶劑去除油污斑一般比用堿液去除油污斑要更快速，其缺點是有機溶劑揮發易造成環境影響。

（7）生物化學清洗主要是針對生物污染物的方法。人們很早發現了微生物對石材的侵蝕和污染作用，有效的清除方法是選用具有針對性的殺滅、溶解、分解、剝離的生物化學清洗劑進行清洗。
石材清洗的最大特點是污染物大多寄居在石材的十分微小的孔隙中（大多是微米級微孔），清洗劑需要滲入石材微孔，在微孔中作用，并將清洗后的殘液吸出或沖淡。由于石材微孔的限制包庇作用，使石材的清洗具有較大的難度。總之，弄清石材污垢的結構和性質，了解石材本身的特點，有針對性地選擇適宜的清洗方法或復合方法，是清洗工作的最重要環節，就象醫生看病一樣。